En un avance significativo para la investigación científica en la Comunidad de Madrid, la unidad de servicios científicos del Parque Científico de Madrid (PCM) ha lanzado un innovador servicio de transcriptómica espacial utilizando la técnica Stereo-seq de STOmics. Este servicio, que marca un hito al ser el segundo de su tipo en todo el país, ha sido desarrollado y validado en colaboración con el prestigioso Centro Nacional de Biotecnología (CNB-CSIC).
La transcriptómica espacial representa una revolución en la forma en que se analiza el genoma, permitiendo obtener una vista detallada de la ubicación de las células dentro de los tejidos sin perder información crítica. Este enfoque supera una de las limitaciones más significativas de la genómica tradicional al proporcionar un análisis a nivel subcelular, algo que hasta ahora resultaba inalcanzable con métodos que requerían la disgregación de las muestras. El resultado es un perfil genético preciso acompañado de su contexto espacial, crucial para entender las interacciones celulares en su entorno natural.
El funcionamiento de esta técnica se sustenta en la avanzada tecnología proporcionada por el Grupo MGI y STOmics, mediante el uso de la metodología STEREO-seq, que proporciona una resolución excepcionalmente alta sin intervenir en la integridad del análisis genómico. Este método hace uso de las matrices DNBSEQ, las cuales se caracterizan por sus puntos de captura nanométricos —distanciados apenas 220 nm— y las nanobolas de ADN, asegurando así la captura completa del transcriptoma sin sesgos y con una notable precisión.
Para maximizar la eficacia del servicio, el PCM ha establecido un flujo de trabajo integral, abarcando desde el procesamiento inicial del tejido hasta el análisis detallado de los datos. Este enfoque ha sido desarrollado en estrecha colaboración con diversos servicios del CNB-CSIC, lo que ha permitido obtener una certificación oficial por parte de STOmics y MGI, garantizando la calidad y fiabilidad del servicio.
Este recurso no solo es un avance tecnológico sino también estratégico para el ecosistema de investigación, desarrollo e innovación (I+D+i), ofreciendo una herramienta esencial para la investigación en campos como la embriología, la neurociencia, la biología vegetal y la oncología de precisión. En particular, dentro de la oncología, la capacidad de analizar la heterogeneidad tumoral y el microambiente del cáncer abre nuevas posibilidades para la medicina personalizada.
El nuevo servicio de transcriptómica espacial está ya disponible para una amplia gama de investigadores y entidades, incluyendo universidades, hospitales, empresas biofarmacéuticas y biotecnológicas, así como grupos de investigación en el ámbito de la deep tech.
Para divulgar en mayor detalle esta técnica y sus pormenores, el PCM ha programado un seminario para el próximo 30 de octubre, donde expertos como Javier Batista de MGI y María José López del PCM expondrán los aspectos técnicos y bioinformáticos del nuevo servicio. Las inscripciones para este evento ya están abiertas a través de la página del Seminario Transcriptómica Espacial STOmics, proporcionando una oportunidad única para conocer de primera mano el impacto potencial de esta innovadora herramienta en la investigación científica.
